Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 RAB7B-201ENST00000617070 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 KLK2-203ENST00000391810 2674 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SCNM1-202ENST00000368905 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AL512274.1-201ENST00000562471 2027 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AC009159.4-201ENST00000624606 2031 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 LILRB2-204ENST00000391749 2286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 IGF2BP2-201ENST00000346192 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 RNF219-AS1-209ENST00000606429 2418 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 PRAMEF27-201ENST00000436041 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 DACH2-201ENST00000373125 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AL590552.1-201ENST00000623164 1770 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AC092145.1-201ENST00000564809 2434 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TNFAIP3-211ENST00000621150 1613 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SLC4A5-204ENST00000377634 3814 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ZNF714-203ENST00000596053 800 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms