Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KHDC1Q4VXA5 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KHDC1Q4VXA5 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KHDC1Q4VXA5 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KHDC1Q4VXA5 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KHDC1Q4VXA5 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KHDC1Q4VXA5 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
KHDC1Q4VXA5 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KHDC1Q4VXA5 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KHDC1Q4VXA5 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KHDC1Q4VXA5 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KHDC1Q4VXA5 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms