Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms