Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HIF1AQ16665 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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