Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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SSX1Q16384 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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SSX1Q16384 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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SSX1Q16384 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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SSX1Q16384 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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SSX1Q16384 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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SSX1Q16384 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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SSX1Q16384 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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SSX1Q16384 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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SSX1Q16384 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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