Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEUROD1Q13562 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms