Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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