Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CSTF3Q12996 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CSTF3Q12996 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSTF3Q12996 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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