Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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TWF1Q12792 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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