Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXO1Q12778 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXO1Q12778 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms