Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC173Q0VFZ6 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms