Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC007228.2-201ENST00000602145 1328 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 TGIF1-203ENST00000345133 1088 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 SLC8A1-AS1-204ENST00000427354 790 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AP005597.1-201ENST00000534192 802 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 BLOC1S6-208ENST00000565323 688 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC005154.1-216ENST00000582145 1101 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC007292.3-201ENST00000594776 357 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 BCL11A-204ENST00000359629 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 FCHO2-201ENST00000287761 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 TBC1D3P4-201ENST00000338790 1075 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 RPL5P28-201ENST00000418634 693 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms