Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SPTBN1Q01082 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTBN1Q01082 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 371 ms