Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERVFC1P60507 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms