Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF135P52742 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms