Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CRIP1P50238 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms