Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPA3P35244 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPA3P35244 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA3P35244 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA3P35244 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms