Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXD10P28358 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXD10P28358 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms