Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDK11BP21127 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms