Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTN1P12814 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms