Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM228BP0C875 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM228BP0C875 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM228BP0C875 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM228BP0C875 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM228BP0C875 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM228BP0C875 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM228BP0C875 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms