Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
UBXN7O94888 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms