Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP2O75323 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms