Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRICKLE3O43900 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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