Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COCHO43405 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COCHO43405 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COCHO43405 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms