Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMX2A2RU54 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms