Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNA3Q9UI47 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms