Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN9

AIPL1, Aryl-hydrocarbon-interacting protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIPL1Q9NZN9 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AIPL1Q9NZN9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms