Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA4BQ9NPR2 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA4BQ9NPR2 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms