Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB18Q9NP72 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms