Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms