Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM5Q9C035 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms