Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIFKQ9BYG3 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms