Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
HERPUD2Q9BSE4 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERPUD2Q9BSE4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms