Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FYCO1Q9BQS8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms