Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC7Q96M83 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC7Q96M83 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms