Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.2 ms