Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT35Q92764 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms