Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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RABGGTAQ92696 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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RABGGTAQ92696 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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RABGGTAQ92696 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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RABGGTAQ92696 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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RABGGTAQ92696 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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RABGGTAQ92696 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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RABGGTAQ92696 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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RABGGTAQ92696 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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RABGGTAQ92696 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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RABGGTAQ92696 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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RABGGTAQ92696 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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RABGGTAQ92696 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RABGGTAQ92696 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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