Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHA9Q7RTU4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms