Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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