Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GRAMD4Q6IC98 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms