Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CARMIL2Q6F5E8 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms