Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC9A4Q6AI14 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC9A4Q6AI14 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms