Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LGSNQ5TDP6 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.1 ms