Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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C10orf55Q5SWW7 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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