Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
NTRK2Q16620 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
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