Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DDB1Q16531 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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