Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCP1Q15431 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms