Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
SHPRHQ149N8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
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